A passagem que você cita é a genealogia de Jesus segundo Mateus. Lendo ela completa, a partir de 1,1, vemos que Mateus diz:

Abraão foi o pai de Isaac; Isaac foi o pai de Jacó; 3 Jacó foi o pai de Judá e de seus irmãos. Judá, com Tamar, foi o pai de Farés e Zara;

Mais adiante, no versículo que você menciona (15-16), lemos: 

Eliud foi o pai de Eleazar; Eleazar foi o pai de Matã; Matã foi o pai de Jacó. 16 Jacó foi o pai de José, o esposo de Maria, da qual nasceu Jesus, que é chamado o Messias.

Evidentemente Mateus está falando de dois Jacós.

O terceiro entre os patriarcas, Jacó, é mencionado no início da genealogia, enquanto que o pai de José, esposo de Maria, também se chamava Jacó. São dois personagens separados por cerca de 2 mil anos. Infelizmente nada sabemos desse Jacó, avô putativo de Jesus.